Para actualizar una versión tan antigua lo mejor es que uses el CD de instalación.
1) Descarga la ultima iso de SME server
2) Quema el CD
3) Arranca tu server con este CD y sigue los pasos de actualización.
4) Luego reinicia, entra como root y ejecuta:
yum clean all
yum update
signal-event post-upgrade; signal-event reboot
Así tendras tu server totalmente al día.
Por otro lado, ese tipo de problema se me presentaba cuando entraba a través del Webmail, es decir Horde y cuando los archivos adjuntos pasaban los 3 MB. de tamaño que es el máximo definido en Horde, sin embargo cuando configuraba cualquier cliente de correo, thunderbird, outlook express, etc. Descargaba sin problemas los adjuntos (No se si será el mismo problema). El límite creo que venía por la configuración de PHP que es sobre lo cual esta desarrollado Horde. Sin embargo en las versiones nuevas esos límites creo que ya se han aumentado.
Aqui puedes revisar los valores de las Variables de Configuración.
http://wiki.contribs.org/DB_Variables_Configuration#Horde_.28webmail.29Revisa tus límites en Horde y PHP.
Saludos cordiales
Daniel Loayza